山西省农业科学院农业环境与资源研究所成立于1959年，其前身为山西省农业科学院土壤肥料研究所，是山西省农科院建所最早的研究所之一。
福建省农业科学院成立于1960年，是福建省最高的农牧业综合科研机构。现设有水稻、果树、畜牧兽医、植物保护、土壤肥料、甘蔗、茶叶、作物、农业工程技术、农业经济与科技信息、农业生态、生物技术、农业生物资源等研究所和中心实验室、蘑菇菌种研究推广站等15个研究单位和1个科技干部培训中心。
安徽省农业科学院是省政府直属综合性农业科研事业单位，1960年建院。下设研究机构有水稻、作物、棉花、畜牧、园艺、水产、茶叶、农产品加工等14个专业研究所。
杭州市农业科学研究院（Hangzhou Academy of Agricultural Sciences）成立于2004年3月，是根据市委、市政府整合农业科技资源的要求，撤消原4个农口研究所，重新组建的综合性农业科研、推广机构，为市政府直属事业单位。
青岛市农业科学研究院是青岛市属唯一的综合性农业科研机构，承接“青岛市农业科学研究所”的基础，于2002年12月正式建制。作为农业科研教学单位，可追溯至始建于1908年的“德华高等学堂”附设的胶澳农事试验场，至今已有百年的历史。历经一个世纪的风雨沧桑，如今的青岛市农业科学研究院，已发展成为一所研究学科比较齐全、设备设施先进、成果转化效益显著，人才济济、成果累累，科研开发综合实力位居“全国百强”，国内外闻名遐迩的地市级农业科学院。
重庆市农业科学院是以原重庆市农业科学研究所、市果树研究所、市作物研究所、市茶叶研究所、市农业机械研究所为基础，由重庆市人民政府于2005年12月批准成立的正厅局级全民所有制公益型农业科研事业单位。