上海市精神卫生中心又名上海市心理咨询中心，原名上海市精神病防治院，前身为普慈疗养院，始建于1935年。2006年5月上海市精神卫生中心正式成为上海交通大学医学院的附属医院。上海市精神卫生中心是上海市三级甲等精神卫生专科医院，担负着全市精神卫生的医疗、教学、科研、预防、康复、心理咨询和对外学术交流等任务。
复旦大学附属肿瘤医院是国家卫生部直属的，集医疗、教学、科研、预防为一体的三级甲等肿瘤专科医院，是国内历史悠久、享有盛誉的肿瘤专科医院，其前身是中比镭锭治疗院，于1931年3月1日正式成立，至今已有七十九年的历史，是我国成立最早的肿瘤专科医院。
复旦大学附属儿科医院创建于1952年，由西门妇孺医院分院、中国红十字会第一医院和中山医院儿科合并而成。首任院长为儿科学一级教授陈翠贞。建院初期，以西门妇孺医院分院旧址为院址，1954年枫林路183号新医院启用。2000年4月原上海医科大学与复旦大学合并，更名为复旦大学附属儿科医院。医院设施优良，人才云集，是集医教研为一体的综合性儿童专科医院，系卫生部部属“三级甲等”医院。是全国儿科学重点学科、国家"211工程"建设单位。是最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授权点、临床医学（儿科学组）博士后流动站。
复旦大学附属眼耳鼻喉科医院成立于1952年7月1日，是由中国红十字会第一医院及中山医院的眼科和耳鼻喉科合并而成的，是上海医学院的一所专科性的教学医院。1985年改名为上海医科大学附属眼耳鼻喉科医院。1999年上海医科大学与复旦大学合并后，医院更名为复旦大学附属眼耳鼻喉科医院。
上海沪申五官科医院是上海远大医疗集团投资的上海唯一一家五官专科医院，也是改革开放以来上海诞生的第一家颇具规模的五官专科医院。医院拥有三大品牌科室：眼科、口腔科、耳鼻喉科。眼科：飞秒激光＋波导准分子激光治近视、微创治斜视、超声乳化＋人工晶体植入治疗白内障、微创玻切术治视网膜脱离、泪道激光治泪道疾病。口腔科：烤瓷牙、冷光美白牙、MBT正畸、种植牙。耳鼻喉科：低温等离子技术治疗鼻炎、扁桃体炎、腺样体肥大及鼾症，微创术治中耳炎，鼻内窥镜下功能性手术治疗鼻窦炎、鼻息肉。
上海江城医院耳鼻咽喉治疗中心是上海首家高起点、高品质的以专业五官科为特色的综合性大型医疗机构，医院集诊疗、预防、保健、科研于一体，耳、鼻、咽喉专科是我院重点科室之一。上海江城医院耳鼻咽喉治疗中心拥有国内一流的检验中心、国际领先的检验仪器、高精尖的诊疗设备和资深的耳鼻咽喉科医学专家，秉承严谨求实的科学态度和诚信求精的行医宗旨，全心致力于耳鼻咽喉科疾病的专科课题研究与临床治疗。
中国福利会国际和平妇幼保健院（以下简称“保健院”）是1952年由前国家名誉主席宋庆龄为保护妇女和儿童健康而创办的医院。前身是上海胶州路妇幼保健站和沪西女工保健站，均设立在沪西纱厂女工较多的地区。
上海市第八人民医院创建于1947年，是一所集医疗、教学、科研、体检为一体的花园式综合性二级甲等医院。医院现为江苏大学附属医院、上海交通大学附属上海市第六人民医院医疗集团核心成员单位，是上海市中医药大学、上海市职工医学院教学医院。是徐汇区区域医疗中心、徐汇区急救中心、上海市120分站、徐汇区传染病防治中心和徐汇区弃婴收治中心。
上海市胸科医院(又名上海交通大学附属胸科医院和上海红十字会胸科医院)创建于1957年，为我国最早建立的集医疗、教学、科研为一体的，以诊治心、肺、食管、气管、纵隔疾病为主的专科医院，首任院长黄家驷，副院长兰锡纯、顾恺时。1957年起被卫生部指定为全国心胸外科进修基地，1988年起成为原上海第二医科大学教学医院，1994年被评为三级甲等医院。2004年成为上海市红十字胸科医院，2005年成为上海交通大学附属胸科医院。医院先后获“全国卫生系统先进集体”、“上海市职业道德建设十佳单位”、“市文明单位”四连冠等殊荣。
上海市针灸经络研究所的前身是上海市针灸研究所（1958年成立）和上海市经络研究所（1964年成立）。1971年针灸研究所、龙华医院、经络研究所合并成立上海市中医研究所。1980年上海市针灸经络研究所恢复成立。2002年为了促进科研与临床的紧密结合，上海市针灸经络研究所与岳阳医院合并。上海市针灸经络研究所（简称针研所）是上海中医药研究院和上海中医药大学下属研究机构，也是我国最早建立、规模最大的针灸专业研究机构之一。