苏州大学附属第一医院始创于1883年(清光绪九年),时称“苏州博习医院”,1954年10月易名为苏州市第一人民医院,1957年成为苏州医学院附属医院,2000年苏州医学院并入苏州大学,医院更名为苏州大学附属第一医院。1994年医院通过江苏省首批卫生部三级甲等医院评审,为江苏省卫生厅直属的省级重点医院,并成为苏南地区医疗指导中心。
苏州大学附属第二医院又名核工业总医院,从一开始便以使命感和责任感,注定了一路的与众不同。为承担国家核能事业重任提供医疗保障,为苏州市民提供优质高效的医疗服务,为扩大临床教学规模促进教育事业,苏州大学附属第二医院以时代之遇,于1988年应运而生。由于同法国多所大学和医疗中心保持着良好的合作与交流,1992年,医院挂牌为“中法友好医院”。2002年,医院被正式批准为国家核事故应急后援组织之一,成为国家级应急单位。院内设有中国核工业辐射损伤医学应急中心、秦山核电核事故应急医疗中心。
苏州大学附属儿童医院,又名苏州市儿童医院,位于江南历史文化名城苏州市中心繁华地段,隶属于江苏省卫生厅。 1959年,在原苏州医学院附属第一医院儿科的基础上独立组建,经过几代人的努力,现已发展成为一所集医疗、教学、科研、预防保健为一体的综合性三级儿童医院。2001年设立苏州大学儿科医学研究所。医院多次被评为江苏省、苏州市文明单位,2005年被评为江苏省医院管理年活动先进单位。