福建医科大学图书馆
福建医科大学图书馆现由上街校区图书馆、台江校区图书馆、四所直属附属医院（附属第一医院、附属第二医院、附属协和医院、附属口腔医院）分馆三个部分组成，总建筑面积2.8万平方米，馆藏总量150万册。其中，纸质馆藏79.2万册，数字馆藏95.8万册。已形成以现代医学和生物学科为主、以人文社会学科为辅的具有本校特色的馆藏体系。福建医科大学图书馆内部管理机构设有办公室、采访编目部、流通部、期刊与检索部、技术部、医学文献检索教研室、图像技术部等部门。图书馆面向全校读者（含附属医院读者）提供数字化文献信息服务，所有数字资源网上24小时开放服务。两校区图书馆提供书刊借阅、音像制作、文献复制、远程传递、检索查新、参考咨询等业务服务，以及医学文献检索教学和学报编辑、出版、发行。同时开展读者辅导讲座，在职继续教育培训，特色数据库建设，学术研究活动，以满足各层次读者需求。
福建医科大学
福建医科大学创建于1937年，其前身是福建省立医学专科学校。1939年改名为福建省立医学院。1949年改称福建医学院。1969年，与福建中医学院、华侨大学医疗系合并，成立福建医科大学。1982年更名为福建医学院。1996年4月改为现名。 经过70多年的建设发展，学校已形成学士硕士博士人才培养体系和勤奋、严谨、求实、创新优良校风，成为一所集教学、科研、医疗、预防和社会服务为一体的省属医科大学。2003年，被福建省人民政府确定为重点建设高校。同年以良好的成绩通过了教育部本科教学工作水平评估。
福建医科大学附属第一医院
福建医科大学附属第一医院是我省目前规模最大的集医疗、教学、科研于一体的专业技术人才高度密集的大型综合性三级甲等医院之一。医院创建于1937年，1993年被国家卫生部、世界卫生组织授予“爱婴医院”，1995年被国家卫生部评为福建省首批“三级甲等医院”，2001年成为福建医科大学第一临床医学院。2005年医院成建制接收福建炼化公司职工医院，并成立福建医科大学附属第一医院闽南分院。
福建医科大学口腔医学院附属口腔医院
福建医科大学口腔医学系成立于1984年，2000年10月改系建院。学院建立有从学士、硕士到博士的完整学位教育体系。 口腔基础教研室、牙体牙髓病学、牙周病学、儿童口腔医学、预防口腔医学、口腔黏膜病学、口腔颌面外科学、口腔修复学、口腔正畸学9个教研室及口腔医学实验教学中心和实验中心，有12个临床实习基地。
福建医科大学附属南平第一医院
南平市第一医院座落在武夷山下延平湖畔，1905年成立，已有百年历史，是闽北规模最大、实力最雄厚的三级甲等综合性医院,是福建医科大学非行政附属医院、福建医科大学及福建中医药大学硕士研究生培养点，福建省卫生厅住院医师规范化培训基地。