济宁医学院前身是创建于1952年的山东省济宁医士学校,1958年改为济宁医学院,招收第一届本科生;1959年改为济宁医学专科学校; 1987年1月,经原国家教育委员会批准,更名为济宁医学院;2008年4月学校以“优秀”成绩顺利通过国家教育部本科教学工作水平评估。
济宁医学院附属医院座落在济宁市中区繁华的古槐路上,始建于1951年,其前身为济宁市红十字会医院、济宁市立医院,1987年经原国家教委和山东省人民政府批准改为现称。
金乡县人民医院始建于1949年12月,1993年成为鲁西南地区首家二级甲等医院,现已发展为具有三级医院规模和技术水平的综合性医院,2002年11月成为济宁医学院非直属附属医院。