新疆医科大学第一临床医学院暨第一附属医院(原名为新疆医学院附属医院),一九五六年建院。五十余年来经过几代创业者艰苦努力,现已形成一所集医疗、教学、科研为一体的大型综合性教学医院和高级医学人才的培养基地。
创建于1954年,经历了50多年风雨历程的新疆医科大学第二附属医院是一所集医疗、教学、科研、康复、预防为一体的省级综合医院,国家卫生部首批认定的“三级甲等”医院,自治区政府评定的“患者满意单位”和自治区级文明单位。
新疆医科大学第五附属医院(原乌鲁木齐铁路中心医院)成立于1937年,至今具有73年的辉煌历史。其前身为“镇江铁路医院”,1958年以“兰州基地医院”进疆后,更名为乌鲁木齐铁路局中心医院。2004年6月,随着铁路主辅分离改革,医院整建制移交新疆医科大学,成为新疆医科大学第五附属医院暨第五临床医学院。