山东中医药大学原称山东中医学院,创建于1958年。1978年被列为全国重点建设的中医药院校并招收首届研究生,为全国首批招收中医研究生的单位之一。1981年被山东省政府列为省属重点院校,被国务院学位委员会批准为全国高等中医药院校首批学士和硕士学位授予单位。
山东中医药大学附属医院、山东省中医院成立于1955年7月,经过半个世纪的励精图治,现已成为省内规模大、科室设置全、业务水平高、教学实力强的一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体的现代化综合性中医医院。医院是以中医为基础、中西医结合的综合性三级甲等中医院,也是山东省唯一一所省级三级甲等中医医院。
山东中医药大学第二附属医院的前身是济南铁路中心医院,创建于1904年,是山东省首批、济南市第一家综合性三级甲等医院,2004年12月整建制移交山东中医药大学管理,成为山东中医药大学第二附属医院暨第二临床医学院。2007年9月,被山东省政府确定为山东省中西医结合医院,成为全省唯一的省级中西医结合医院。国际爱婴医院、国家中医药管理局“治未病”预防保健试点单位、国家中医药管理局批准纳入全国重点中西医结合医院建设单位。