复旦大学
复旦大学创建于1905年，原名复旦公学，是中国人自主创办的第一所高等院校，创始人为中国近代知名教育家马相伯。“复旦”二字选自《尚书大传・虞夏传》中“日月光华，旦复旦兮”的名句，意在自强不息，寄托当时中国知识分子自主办学、教育强国的希望。
复旦大学附属中山医院(上海市中山医院)
复旦大学附属中山医院是卫生部部属综合性教学医院。医院开业于1937年，是当时中国人管理的第一所大型综合性医院，隶属于国立上海医学院，为纪念中国民主革命的先驱孙中山先生而命名为孙中山纪念医院，后更名为中山医院。解放后曾称上海第一医学院附属中山医院和上海医科大学附属中山医院，2001年用现名。
复旦大学附属肿瘤医院(上海市肿瘤医院)
复旦大学附属肿瘤医院是国家卫生部直属的，集医疗、教学、科研、预防为一体的三级甲等肿瘤专科医院，是国内历史悠久、享有盛誉的肿瘤专科医院，其前身是中比镭锭治疗院，于1931年3月1日正式成立，至今已有七十九年的历史，是我国成立最早的肿瘤专科医院。
复旦大学附属儿科医院
复旦大学附属儿科医院创建于1952年，由西门妇孺医院分院、中国红十字会第一医院和中山医院儿科合并而成。首任院长为儿科学一级教授陈翠贞。建院初期，以西门妇孺医院分院旧址为院址，1954年枫林路183号新医院启用。2000年4月原上海医科大学与复旦大学合并，更名为复旦大学附属儿科医院。医院设施优良，人才云集，是集医教研为一体的综合性儿童专科医院，系卫生部部属“三级甲等”医院。是全国儿科学重点学科、国家"211工程"建设单位。是最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授权点、临床医学（儿科学组）博士后流动站。
复旦大学附属眼耳鼻喉科医院(上海市五官科医院)
复旦大学附属眼耳鼻喉科医院成立于1952年7月1日，是由中国红十字会第一医院及中山医院的眼科和耳鼻喉科合并而成的，是上海医学院的一所专科性的教学医院。1985年改名为上海医科大学附属眼耳鼻喉科医院。1999年上海医科大学与复旦大学合并后，医院更名为复旦大学附属眼耳鼻喉科医院。
复旦大学附属华山医院宝山分院
复旦大学附属华山医院宝山分院位于宝山区长江西路1999号，是宝山区政府投资1.4亿元新建的二级综合性医院。2006年10月，区委、区政府从医院的长远发展出发，方便于民，造福于民，决定将仁和医院委托给复旦大学附属华山医院全面管理。本着“创新和探索”的精神，经上海市卫生局批准，医院正式冠名为复旦大学附属华山医院宝山分院。医院托管后仍属于全民事业单位，继续享受上海市医保定点单位待遇。
复旦大学附属上海市第五人民医院
复旦大学附属上海市第五人民医院成立于1904年，前身为英国人建造的“西人隔离医院”，院址旧称靶子路41号（现武进路85号）。1945年，改名为“上海市市立第五医院”。新中国成立后，命名为“上海市立第五人民医院”，我国一代名医张涤生、李宝实、张锡泽、彭友珍、陶滦、应元岳、马永江等均曾在医院工作过。
上海市公共卫生临床中心(复旦大学附属公共卫生临床中心)
上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心（简称“中心”）是复旦大学附属三级甲等医院；是全国传染病医师进修教育培训基地、中国疾病预防控制中心艾滋病临床进修教育基地、上海市疾病控制中心临床基地；复旦大学传染病国家教育部重点学科组成部分，复旦大学妇产科学国家教育部重点学科组成部分，上海市传染病重点学科建设单位之一；国家级药物临床试验机构资格认定单位；上海市危重孕产妇会诊抢救中心、上海市产科肝病监护中心、上海市艾滋病诊疗中心、国家中医药管理局中医药防治传染病重点研究室（临床基地）建设单位和上海市传染科临床质量控制中心之挂靠单位。